El Comité Binacional es la máxima autoridad del Programa, integrado por 2 representantes del Gobierno de Honduras y 2 del Gobierno de España, el cual es el responsable, entre otros aspectos, de definir las políticas de administración de los recursos del Programa y de aprobar la priorización y el financiamiento de proyectos.
Los miembros del Gobierno de Honduras la integran:
- Sr. Roberto Ramirez - Subsecretario de Estado en el Despacho de Crédito e Inversión Pública, Secretaria de Finanzas.
- Sr. Orlando Garner - Director General de Crédito Público, Secretaría de Finanzas.
Por parte del Gobierno Español la conforman:
- Sr. Alberto Sabido Martin - Sub-Director General de Gestión de la Deuda Externa y Financiación Internacional del Ministerio de Asuntos Económicos y Transformación Digital de España.
- Sr. Bernardo de Lizaur - Agregado Comercial Jefe de la Oficina Económica y Comercial de la Embajada de España en Honduras.
Para coadyuvar a una adecuada selección y ejecución de proyectos financiados por el Programa, se creó el Comité Técnico, el cual está representado por 4 funcionarios del Gobierno de Honduras y 2 funcionarios del Gobierno del Reino de España.
Los miembros son:
Por parte de Honduras
- Lic. Jacobo Herrera - Representante de Dirección General de Crédito Público, Secretaría de Finanzas.
- Sra. Jackeline Molina - Representante de la Dirección de Inversión Pública, Secretaría de Finanzas.
- Sra. Rosa Nolvia Valladares - Representante de la Secretaria de Relaciones Exteriores y Cooperación Internacional.
- Sr. Rider Cálix - Representante de la Secretaría de Desarrollo Social.
Por parte de España
- Sr. Bernardo de Lizaur - Agregado Comercial Jefe de la Oficina Comercial de la Embajada de España en Honduras.
- Sr. Francisco José Tomás Moratalla - Representante de la AECID en Honduras.
La Instancia Administradora, es el Banco Centroamericano de Integración Económica(BCIE), quien, por Convenio de Administración suscrito el 25 de enero de 2016, firmado entre el Reino de España, la República de Honduras y el BCIE, es el responsable de la administración de los Fondos del Programa.